Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl41A2AUC9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms