Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtf1A2AQ19 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rtf1A2AQ19 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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