Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Trbv31A0A075B5J5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv31A0A075B5J5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trbv31A0A075B5J5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv31A0A075B5J5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trbv31A0A075B5J5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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