Protein–RNA interactions for Protein: Q8R323

Rfc3, Replication factor C subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc3Q8R323 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc3Q8R323 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc3Q8R323 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc3Q8R323 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc3Q8R323 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc3Q8R323 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc3Q8R323 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc3Q8R323 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc3Q8R323 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc3Q8R323 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc3Q8R323 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc3Q8R323 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc3Q8R323 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc3Q8R323 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc3Q8R323 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc3Q8R323 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc3Q8R323 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc3Q8R323 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc3Q8R323 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc3Q8R323 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc3Q8R323 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc3Q8R323 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc3Q8R323 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc3Q8R323 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc3Q8R323 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc3Q8R323 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc3Q8R323 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc3Q8R323 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc3Q8R323 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc3Q8R323 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc3Q8R323 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfc3Q8R323 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms