Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms