Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NubplQ9CWD8 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1548.8 ms