Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ccdc71Q8VEG0 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ccdc71Q8VEG0 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ccdc71Q8VEG0 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ccdc71Q8VEG0 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ccdc71Q8VEG0 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Ccdc71Q8VEG0 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Ccdc71Q8VEG0 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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