Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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