Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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