Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Creb5-202ENSMUST00000203487 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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