Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Tbx22-203ENSMUST00000168174 5217 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PatjQ63ZW7 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms