Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Foxn1-201ENSMUST00000108294 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Pwwp2a-203ENSMUST00000109280 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp48Q3V0C5 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms