Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Puf60Q3UEB3 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Puf60Q3UEB3 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms