Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms