Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Chd1P40201 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Chd1P40201 Tfcp2l1-201ENSMUST00000027629 9269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Zfp84-201ENSMUST00000032802 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Chd1P40201 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm10556-201ENSMUST00000180904 3906 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Fam212b-201ENSMUST00000066610 4701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 452.8 ms