Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RxraP28700 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RxraP28700 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
RxraP28700 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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