Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
P10404 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
P10404 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
P10404 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
P10404 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm43409-201ENSMUST00000195921 2162 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm15574-201ENSMUST00000119937 405 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm20485-201ENSMUST00000174452 394 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm3011-201ENSMUST00000215669 582 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm6418-201ENSMUST00000118325 3577 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Stx8-203ENSMUST00000108675 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm28444-201ENSMUST00000190777 2137 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
P10404 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
P10404 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms