Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Prrt4B2RU40 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Prrt4B2RU40 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms