Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprsB0V2N1 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprsB0V2N1 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprsB0V2N1 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprsB0V2N1 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprsB0V2N1 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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PtprsB0V2N1 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprsB0V2N1 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprsB0V2N1 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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PtprsB0V2N1 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprsB0V2N1 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprsB0V2N1 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprsB0V2N1 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprsB0V2N1 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprsB0V2N1 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprsB0V2N1 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprsB0V2N1 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprsB0V2N1 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprsB0V2N1 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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