Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Pdpk1Q9Z2A0 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Pdpk1Q9Z2A0 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Pdpk1Q9Z2A0 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Pdpk1Q9Z2A0 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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