Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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Rnft1Q9DCN7 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rnft1Q9DCN7 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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Rnft1Q9DCN7 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Rnft1Q9DCN7 Olfr324-202ENSMUST00000214990 3624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Rnft1Q9DCN7 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Rnft1Q9DCN7 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Rnft1Q9DCN7 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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