Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 D830032E09Rik-203ENSMUST00000189845 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 C2cd5-202ENSMUST00000111758 4062 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Rpl23a-ps3-201ENSMUST00000104925 468 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Kcnd3os-202ENSMUST00000143893 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Pard3b-201ENSMUST00000046673 3426 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Zfp384-203ENSMUST00000084275 2829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Slc5a1-201ENSMUST00000011178 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Mbtd1-206ENSMUST00000107854 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm21784-201ENSMUST00000186639 694 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm9142-201ENSMUST00000187161 955 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Riok3Q9DBU3 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms