Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atoh8Q99NA2 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms