Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Zfp563-201ENSMUST00000131722 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Epn2-201ENSMUST00000001063 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Zmat3-203ENSMUST00000168566 7672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Acbd5-202ENSMUST00000114523 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms