Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ccdc71Q8VEG0 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ccdc71Q8VEG0 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ccdc71Q8VEG0 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc71Q8VEG0 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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