Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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