Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Usp47Q8BY87 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp47Q8BY87 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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