Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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