Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm25095-201ENSMUST00000104047 131 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm8877-201ENSMUST00000172657 655 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Retnlb-201ENSMUST00000023328 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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