Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms