Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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