Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Ttc39dQ0VF76 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Ttc39dQ0VF76 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Ttc39dQ0VF76 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Ttc39dQ0VF76 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Ttc39dQ0VF76 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Ttc39dQ0VF76 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Ttc39dQ0VF76 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Ttc39dQ0VF76 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Ttc39dQ0VF76 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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