Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ttc21bQ0HA38 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ttc21bQ0HA38 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc21bQ0HA38 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms