Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprkP35822 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprkP35822 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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