Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Hist2h2be-201ENSMUST00000090781 2620 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Prg4-202ENSMUST00000111901 3495 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Ubap2l-220ENSMUST00000199834 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Neu3-201ENSMUST00000036331 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Ece2-207ENSMUST00000079600 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Galk2-201ENSMUST00000028636 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Fam212b-201ENSMUST00000066610 4701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gpr85-203ENSMUST00000115492 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Dubr-205ENSMUST00000191079 2105 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm16465-201ENSMUST00000118585 1758 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Erc2-210ENSMUST00000211145 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm10556-201ENSMUST00000180904 3906 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Chn1os1-201ENSMUST00000123613 636 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm15585-201ENSMUST00000149696 670 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm29807-201ENSMUST00000220161 372 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 E030024N20Rik-201ENSMUST00000075293 494 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Ankrd55-201ENSMUST00000022275 2412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4283 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm15128-201ENSMUST00000112814 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm38056-201ENSMUST00000193928 5027 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Mss51-201ENSMUST00000022353 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Serping1-202ENSMUST00000111641 1665 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Il1bos-202ENSMUST00000156601 2425 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Ppwd1-201ENSMUST00000022226 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Otoa-201ENSMUST00000047025 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Tdpoz1-201ENSMUST00000094413 2237 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 AC154227.2-201ENSMUST00000228677 2101 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Cfap43-205ENSMUST00000160247 5264 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prim1P20664 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms