Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rrn3B2RS91 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms