Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Crlf3Q9Z2L7 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Crlf3Q9Z2L7 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms