Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms