Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm8813-201ENSMUST00000155930 595 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Higd1aQ9JLR9 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms