Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Cnga3Q9JJZ8 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Cnga3Q9JJZ8 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Cnga3Q9JJZ8 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Cnga3Q9JJZ8 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Cnga3Q9JJZ8 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Cnga3Q9JJZ8 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Cnga3Q9JJZ8 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Cnga3Q9JJZ8 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Cnga3Q9JJZ8 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Cnga3Q9JJZ8 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Cnga3Q9JJZ8 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms