Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rb1cc1Q9ESK9 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rb1cc1Q9ESK9 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rb1cc1Q9ESK9 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rb1cc1Q9ESK9 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rb1cc1Q9ESK9 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rb1cc1Q9ESK9 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rb1cc1Q9ESK9 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rb1cc1Q9ESK9 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rb1cc1Q9ESK9 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rb1cc1Q9ESK9 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rb1cc1Q9ESK9 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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