Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm11149-202ENSMUST00000215070 1169 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Clstn1Q9EPL2 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms