Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpa3Q9CQ71 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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