Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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