Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Fam228aQ8CDW1 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms