Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NipblQ6KCD5 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms