Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Q3U6N9 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
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Q3U6N9 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Q3U6N9 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Q3U6N9 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Q3U6N9 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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