Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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NcstnP57716 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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NcstnP57716 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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NcstnP57716 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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NcstnP57716 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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NcstnP57716 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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NcstnP57716 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcstnP57716 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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NcstnP57716 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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NcstnP57716 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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NcstnP57716 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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NcstnP57716 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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NcstnP57716 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NcstnP57716 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.9 ms