Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cux1P53564 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cux1P53564 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms