Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms